En este Plan Institucional se presentan los fundamentos en los que se basa la operación del Museo Trompo Mágico y se establecen los lineamientos de su funcionamiento. Este instrumento de planificación se elaboró para lograr los objetivos sustantivos y adjetivos, así como las metas que se fijan a corto, mediano y largo plazo. Asimismo, en él se definen las estrategias que deben seguirse para la continua mejora de la institución, de acuerdo a los programas establecidos en el PED Jalisco 2013-2033 y en los Planes Sectoriales.
A partir de los planes y documentos anteriores, y tras un ejercicio de diagnóstico de la institución, se localizaron los aspectos a mejorar y las áreas de oportunidad para llevar a cabo una transformación que permita alcanzar la visión a futuro. Del mismo modo, se determinaron también los mecanismos para el monitoreo y la evaluación del cumplimiento de los objetivos, para continuar ofreciendo contenidos de calidad a la población.