El presente plan abordará las siguientes temáticas: Marco normativo, la alineación con otros planes y programas, la misión y visión institucional, el código de ética, políticas institucionales, diagnóstico organizacional y situacional, análisis y optimización de la estructura orgánica, principales logros 2011, evaluación de los procesos 2011, objetivos institucionales y su correspondencia con los objetivos estratégicos del PED Jalisco 2030, procesos de la Secretaría 2012, metas e indicadores de desempeño 2012, mecanismos de seguimiento y evaluación 2012 y por último una cartera de proyectos.